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Sofia G. Seabra

Investigadora

Nota CurricularInvestigaçãoTop 5 Publicações

Sofia G. Seabra concluiu o Doutoramento em Biologia (Biologia Evolutiva) pela Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa em 2007. O seu pós-doutoramento incluiu estudos filogenéticos, filogeográficos e de genética populacional que envolveram a aplicação e desenvolvimento de ferramentas de bioinformática. Desde abril de 2020 é Investigadora Auxiliar na área de Bioinformática e Bioestatística na Unidade de Saúde Pública Internacional e Bioestatística, do Instituto de Higiene e Medicina Tropical da Universidade Nova de Lisboa.

Participou em projetos científicos como Investigadora Principal, Co-Investigadora Principal e responsável por tarefas de projeto. Orientou alunos de pós-graduação e participou em comissões de avaliação em teses de doutoramento e mestrado. As atividades letivas incluíram aulas como Professor Auxiliar Convidado de Bioinformática Prática, Biologia Evolutiva e Filogenética. Foi membro de comissões organizadoras e científicas e realizou revisão científica para várias revistas científicas. As atividades de divulgação incluíram a participação nos eventos da Noite Europeia dos Investigadores.

A investigação de pós-doutoramento de Sofia Seabra focou-se na compreensão de padrões e processos evolutivos em estudos de filogenética, filogeografia, estrutura populacional, deteção de seleção, introgressão e associação genótipo / fenótipo, principalmente em espécies de insetos. Os estudos incluíram a análise de dados genómicos e a aplicação de várias ferramentas de bioinformática, incluindo assemblagem de genomas, re-sequenciação e estudos de associação.

No IHMT integra a equipa do Hub de Bioinformática do GHTM com o objetivo de promover e desenvolver ferramentas de bioinformática para investigação.

  1. Seabra SG, Silva SE, Nunes VL, Sousa VC, Martins J, Marabuto E, Rodrigues ASB, Pina-Martins F, Laurentino TG, Rebelo MT, Figueiredo E, Paulo OS. (2019). Genomic signatures of introgression between commercial and native bumblebees, Bombus terrestris, in western Iberian Peninsula – implications for conservation and trade regulation. Evolutionary Applications 12: 679–691. https://doi.org/10.1111/eva.12732
  2. Seabra SG, Fragata I, Antunes MA, Faria GS, Santos MA, Sousa VC, Simões P & Matos M. (2018). Different genomic changes underlie adaptive evolution in populations of contrasting history. Molecular Biology and Evolution 35: 549–563. https://doi.org/10.1093/molbev/msx247
  3. Rodrigues ASB, Silva SE, Pina-Martins F, Loureiro J, Castro M, Gharbi K, Johnson KP, Dietrich CH, Borges PAV, Quartau JA, Jiggins CD, Paulo OS & Seabra SG. (2016). Assessing genotype-phenotype associations in three dorsal colour morphs in the meadow spittlebug Philaenus spumarius (L.) (Hemiptera: Aphrophoridae) using genomic and transcriptomic resources. BMC Genetics 17:144. https://bmcgenet.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12863-016-0455-5
  4. Seabra SG, Brás PG, Martins J, Martins R, Wyatt N, Shirazi J, Rebelo MT, Franco JC, Mateus C, Figueiredo E, Paulo OS. (2015). Phylogeographical patterns in Coenosia attenuata (Diptera: Muscidae), a widespread predator of insect species associated with greenhouse crops. Biological Journal of the Linnean Society, 14, 308–326. https://doi.org/10.1111/bij.12419
  5. Rodrigues ASB, Silva SE, Marabuto E, Silva DN, Wilson MR, Thompson V, Yurtsever S, Halkka A, Borges PAV, Quartau JA, Paulo OS, Seabra SG. (2014). New mitochondrial and nuclear evidences support recent demographic expansion and an atypical phylogeographic pattern in the spittlebug Philaenus spumarius (Hemiptera, Aphrophoridae). PLoS ONE, 9(6): e98375. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0098375

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