• Skip to primary navigation
  • Skip to main content
  • Skip to footer
  • Pessoal
    • Webmail
    • Área de Docentes
    • Área de Não-Docentes
  • Estudantes
    • Webmail
    • Moodle
    • NetP@
    • Biblioteca
    • Escola Doutoral
    • Serviços Académicos
    • Trabalhar no IHMT

IHMT

Instituto de Higiene e Medicina Tropical

  • O Instituto
    • Missão
    • História
    • Mensagem do Diretor
    • Órgãos de governo
    • Docentes e investigadores
    • Unidades de Ensino e de Investigação
  • Ensino
    • Doutoramentos
    • Mestrados
    • Cursos de Especialização
    • Formação transversal
    • Cursos de Curta Duração
    • Ensino à Distância
    • Apoio ao Desenvolvimento
    • Serviços académicos
  • Investigação
    • Centro GHTM
    • Unidade de Clínica Tropical
    • Unidade de Microbiologia Médica
    • Unidade de Parasitologia Médica
    • Unidade de Saúde Pública Global
    • Serviço de Interesse Comum
    • Biobanco
    • Centro Colaborador da OMS
    • Publicações
  • Serviços e gestão
    • Biblioteca
    • Sistema de Qualidade
    • Estatutos e regulamentos
    • Relatórios
    • Contratos públicos
    • Recursos humanos
      • Concursos e bolsas
      • Contratos
      • Avaliação e Desempenho
        • Processo Eleitoral da Comissão Paritária
      • Mobilidade
  • Doenças Tropicais
    • Consulta do Viajante
    • Glossário
    • Museu
    • Vídeos
    • MosquitoWeb
  • Comunidade
    • Cooperação e Desenvolvimento
    • Formação
    • Parcerias
  • Contactos
  • Português
  • English
Home / Archives for Shafer RW

Shafer RW

HIV-1 fitness landscape models for indinavir treatment pressure using observed evolution in longitudinal sequence data are predictive for treatment failure

  • Autores: Beheydt G, Bruzzone B, Camacho RJ, De Luca A, Deforche K, Grossman Z, Imbrechts S, Incardona F, Libin P, Pironti A, Rhee SY, Ruiz L, Sangeda RZ, Shafer RW, Sönnerborg A, Theys K, Torti C, Van de Vijver DA, Van Laethem K, Van Wijngaerden E, Vandamme AM, Vercauteren J, Zazzi M
  • Ano de Publicação: 2013
  • Journal: Infection Genetics and Evolution
  • Link: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23523594

We previously modeled the in vivo evolution of human immunodeficiency virus-1 (HIV-1) under drug selective pressure from cross-sectional viral sequences. These fitness landscapes (FLs) were made by using first a Bayesian network (BN) to map epistatic substitutions, followed by scaling the fitness landscape based on an HIV evolution simulator trying to evolve the sequences from treatment naïve patients into sequences from patients failing treatment.
Ler mais

Prediction of response to antiretroviral therapy by human experts and by the EuResist data-driven expert system (the EVE study).

  • Autores: Altmann A, Boucher CA, Brun-Vezinet F, Harrigan PR, Incardona F, Kaiser R, Lengauer T, Morris L, Obermeier M, Peres Y, Perno CF, Petroczi A, Phanuphak P, Pillay D, Prosperi M, Rosen-Zvi M, Schülter E, Shafer RW, Sönnerborg A, Struck D, Van Laethem K, Vandamme AM, Wensing AM, Zazzi M
  • Ano de Publicação: 2011
  • Journal: HIV medicine
  • Link: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Prediction+of+response+to+antiretroviral+therapy+by+human+experts+and+by+the+EuResist+data-driven+expert+system+(the+EVE+study).

OBJECTIVES:
The EuResist expert system is a novel data-driven online system for computing the probability of 8-week success for any given pair of HIV-1 genotype and combination antiretroviral therapy regimen plus optional patient information. The objective of this study was to compare the EuResist system vs. human experts (EVE) for the ability to predict response to treatment.
Ler mais

Footer

INSTITUTO DE HIGIENE E
MEDICINA TROPICAL
UNIVERSIDADE NOVA DE LISBOA
Rua da Junqueira, 100 1349-008 Lisboa
T +351 213 652 600
geral@ihmt.unl.pt

Consulta do Viajante e Medicina Tropical
T +351 213 652 630
T +351 213 652 690
T +351 91 182 37 48
T +351 91 182 44 67
medicina.viagens@ihmt.unl.pt

Ensino
Investigação
Medicina Tropical
Cooperação

Siga-nos

  • Facebook
  • LinkedIn
  • YouTube

Receber a “newsletter”

© Copyright 2023 IHMT-UNL Todos os Direitos Reservados.
  • Universidade Nova de Lisboa
  • Fundação para a Ciência e a Tecnologia

    Project UID/Multi/04413/2013