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Home / Archives for Li G

Li G

A new ensemble coevolution system for detecting HIV-1 protein coevolution

  • Autores: Eusebio M, Khouri R, Li G, Piampongsant S, Pineda-Pena A-C, Ramon J, Theys K, Vandamme A-M, Verheyen J
  • Ano de Publicação: 2015
  • Journal: Biology Direct
  • Link: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25564011

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An integrated map of HIV genome-wide variation from a population perspective

  • Autores: Faria NR, Khouri R, Lemey P, Li G, Piampongsant S, Pineda-Pena A-C, Theys K, Vandamme A-M, Voet A
  • Ano de Publicação: 2015
  • Journal: Retrovirology
  • Link: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4358901/

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Trends and predictors of transmitted drug resistance (TDR) and clusters with TDR in a local Belgian HIV-1 epidemic

  • Autores: Albert J, Balotta C, Boucher C, De Munter P, Derdelinckx I, Ferreira F, Gomez-Lopez A, Khouri R, Kostrikis LG, Kücherer C, Li G, Littsola K, Nielsen C, Paredes R, Pineda-Peña AC, Schrooten Y, Stanojevic M, Trovão NS, Van Laethem K, Van Ranst M, Van Wijngaerden E, Vandamme AM, Vercauteren J, Vinken L, Wensing A
  • Ano de Publicação: 2014
  • Journal: PLoS One
  • Link: http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0101738

We aimed to study epidemic trends and predictors for transmitted drug resistance (TDR) in our region, its clinical impact and its association with transmission clusters. We included 778 patients from the AIDS Reference Center in Leuven (Belgium) diagnosed from 1998 to 2012. Resistance testing was performed using population-based sequencing and TDR was estimated using the WHO-2009 surveillance list.
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Horizontal gene transfer from human host to HIV-1 reverse transcriptase confers drug resistance and partly compensates for replication deficits

  • Autores: De Baets G, Dekeersmaeker N, Li G, Megens S, Moutschen M, Rousseau F, Schrooten Y, Schymkowitz J, Vaira D, Van Laethem K, Vandamme AM
  • Ano de Publicação: 2014
  • Journal: Virology
  • Link: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24889250

We investigated the origin and the effect of insertion D67D-THGERDLGPA within HIV-1 RT from a patient failing antiviral therapy. The insertion developed within the context of pre-existing NRTI and NNRTI mutations (M41L, L210W, T215Y and N348I).
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HIV-1 Gag C-terminal amino acid substitutions emerging under selective pressure of protease inhibitors in patient populations infected with different HIV-1 subtypes

  • Autores: Li G, Piampongsant S, Theys K, Van Laethem K, Vandamme AM, Verheyen J
  • Ano de Publicação: 2014
  • Journal: Retrovirology
  • Link: http://www.retrovirology.com/content/11/1/79

HIV-1 Gag amino acid substitutions associated with protease inhibitor (PI) treatment have mainly been reported in subtype B, while information on other subtypes is scarce. Using sequences from 11613 patients infected with different HIV-1 subtypes, we evaluated the prevalence of 93 Gag amino acid substitutions and their association with genotypic PI resistance.
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